انطلق عمل الجذور الشعبية المقدسية من قلب مدينة القدس في عام 2011، إيماناً بمركزية المدينة وأهميّتها التاريخية والحالية النابع منها ضرورة وجود جسم جامع للأطر الفاعلة فيها. تتطلّع المؤسّسة إلى دعم الصمود الفلسطيني في المدينة من خلال السعي إلى توفير القاعدة المعرفية اللّازمة للمجتمع والمُساهِمة بتعزيز السردية المقدسية الفلسطينية كأداة مواجهة محلياً وعالمياً، كما نسعى إلى دعم المبادرات والحراكات المجتمعية والتشبيك بينها، في سبيل تحقيق المجتمع لرؤيته وصولاً إلى تحرّره. ونعمل وفقاً لقناعة تقتضي شرط الاستقلال الاقتصادي عن المنظومة الاستعمارية بغية الوصول للتحرّر.